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先进的计算机技术和软件使物种识别互动

2019-04-08 17:20:57   来源:
导读 代表一组成功的生物防治剂用于各种害虫果蝇,寄生黄蜂属仍然在很大程度上被忽视。虽然其最新识别密钥可以追溯到1969年,但自那时以来已添加

代表一组成功的生物防治剂用于各种害虫果蝇,寄生黄蜂属仍然在很大程度上被忽视。虽然其最新识别密钥可以追溯到1969年,但自那时以来已添加了许多新物种。似乎更糟糕的是,这组视觉上相同的物种很可能包含许多尚未被描述为科学新物种的物种。

瑞士伯尔尼自然历史博物馆的科学家Fabian Klimmek和Hannes Baur最近在中欧研究了这些黄蜂的物种群,不仅展示了知识更新的必要性,还展示了现代分类学软件能够分析的优势。大量的描述性和定量数据。

在开放获取的生物多样性数据期刊上发表,该团队的分类学论文描述了一个新物种 -Pteromalus capito- 并讨论了由Pierre-and-Marie的信息学和系统学实验室开发的免费使用的Xper3。 -Curie大学。该软件用于为物种组Pteromalus albipennis创建一个公开可用的更新密钥。

充分说明的交互式数据库涵盖了该组中的27个物种和18个相关物种,除了完整的诊断,大量的身体测量和总共585个图像,显示了每个物种的大部分特征。

“如今,先进的计算机技术,测量程序和设备允许更复杂的方法来包含数量特征,这极大地增强了隐秘物种的划界,”科学家解释说。

“最近开发的用于创建Xper3,Lucid或Delta等生物识别键的软件可能有可能取代传统的纸质键。”

为了将该陈述置于上下文中,作者给出了一个研究的黄蜂种类的例子,如果使用先前可用的识别密钥,其识别将需要16个步骤,而交互式替代方案仅需要6个步骤。

像Xper3这样的工具如此快速和高效的原因之一是,密钥的作者可以按特定顺序列出所有描述性字符,并在物种分隔中赋予它们不同的权重。因此,每当昆虫学家试图识别黄蜂标本时,软件将首先对顶部的描述符进行检查,以便它可以排除不匹配的分类单并提供剩余名称的列表。每当剩下多个名字时,就会在列表的下方进行检查,直到剩下一个,这应该是与样本相对应的一个。在任何时候,研究人员都可以访问年表,以便在不中断过程的情况下检查是否存在任何可能的不匹配。

作为数字可用软件的产品,交互式识别密钥不仅容易,快速且廉价地发布,而且它们也易于以协作方式编辑和构建。只要作者授予他们特定的用户权限,来自世界各地的专家就可以更新密钥。但是,无论数据库的更新次数如何,永久URL链接将始终提供对最新版本的访问。

为了证明其关键及其基础数据的未来发展,科学家们将所有原始数据文件,R脚本,照片,文件列表和准备好的样本存放在由OpenAIRE和CERN创建的研究数据Zenodo中。

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